Regionalt miljøprogram utarbeides for å møte prioriterte miljøutfordringer i fylket, både med hensyn til kulturlandskap og forurensning. Målet er bedre effekt av miljøinnsatsen. Kostnadseffektivitet og synliggjøring er også viktig. Regionalt miljøprogram godkjennes normalt for fire år, men mindre justeringer kan skje årlig. Som en del av Regionalt miljøprogram er det etablert tilskuddsordninger som gjenspeiler de prioriteringene som er omtalt i miljøprogrammet. Ordningene vil derfor variere fra fylke til fylke, men noen ordninger kan være nesten like i flere fylker. Antall ordninger i hvert enkelt fylke varierer. Fylkesmannen disponerer en årlig tilskuddsramme som blir fastsatt i jordbruksoppgjøret.
Fylkesmannen utarbeider Regionalt miljøprogram for fylket i samråd med næringsorganisasjonene, fylkespolitikere og annen miljøfaglig kompetanse. Kommunene får miljøprogrammet til høring før fastsettelse. Statens landbruksforvaltning (SLF) godkjenner de regionale miljøprogrammene etter samråd med avtalepartene i jordbruksoppgjøret.